Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IFFO1Q0D2I5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms