Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GABPAQ06546 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms