Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms