Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNEQ04844 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms