Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLOD1Q02809 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms