Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NHLH2Q02577 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms