Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMAD3P84022 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms