Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VSX2P58304 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX2P58304 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX2P58304 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX2P58304 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX2P58304 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VSX2P58304 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms