Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLDN15P56746 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN15P56746 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN15P56746 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN15P56746 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms