Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLE2P56282 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLE2P56282 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLE2P56282 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLE2P56282 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms