Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA2D1P54289 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA2D1P54289 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms