Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB28P51157 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms