Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NESP48681 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NESP48681 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NESP48681 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
NESP48681 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NESP48681 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NESP48681 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NESP48681 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NESP48681 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms