Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTDSS1P48651 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms