Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GJA8P48165 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms