Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRATP43155 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CRATP43155 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CRATP43155 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRATP43155 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms