Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms