Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ABCC1P33527 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms