Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPS1P31327 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPS1P31327 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms