Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PKLRP30613 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PKLRP30613 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PKLRP30613 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms