Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSFA2P28290 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSFA2P28290 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms