Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HTR2AP28223 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms