Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRGP23470 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms