Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6A1P12074 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms