Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB2P05107 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms