Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSD2O96028 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSD2O96028 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSD2O96028 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSD2O96028 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms