Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAPGEF3O95398 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF3O95398 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF3O95398 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAPGEF3O95398 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
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