Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H7C1D1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H7C1D1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
H7C1D1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H7C1D1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H7C1D1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms