Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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