Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf172C9J069 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms