Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSDA5PKW4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSDA5PKW4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms