Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MAP3K4Q9Y6R4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms