Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAB39Q9Y376 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms