Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRF3Q9ULT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRF3Q9ULT6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms