Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms