Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DKK4Q9UBT3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms