Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARHGAP28Q9P2N2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms