Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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