Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GDAP2Q9NXN4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GDAP2Q9NXN4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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