Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CMTM6Q9NX76 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms