Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWS1

PARPBP, PCNA-interacting partner, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARPBPQ9NWS1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PARPBPQ9NWS1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PARPBPQ9NWS1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms