Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms