Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CENPMQ9NSP4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CENPMQ9NSP4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms