Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SALL1Q9NSC2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms