Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCAF1Q9H7N4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCAF1Q9H7N4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms