Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEMA4CQ9C0C4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms