Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EFHD1Q9BUP0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFHD1Q9BUP0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms