Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCMBPQ9BTE3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms