Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TREX2Q9BQ50 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TREX2Q9BQ50 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms