Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MYCBPQ99417 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms